Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tubgcp4Q9D4F8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms