Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sohlh2Q9D489 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sohlh2Q9D489 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms