Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Rufy3Q9D394 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rufy3Q9D394 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms