Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmbr1lQ9D1E5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmbr1lQ9D1E5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms