Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Lsm12Q9D0R8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms