Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Exosc7Q9D0M0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Exosc7Q9D0M0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms