Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shmt2Q9CZN7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms