Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl35Q9CZ49 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Klhl35Q9CZ49 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl35Q9CZ49 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl35Q9CZ49 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl35Q9CZ49 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl35Q9CZ49 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl35Q9CZ49 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl35Q9CZ49 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Klhl35Q9CZ49 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms