Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cxxc1Q9CWW7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms