Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pin4Q9CWW6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms