Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tdrd12Q9CWU0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms