Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NubplQ9CWD8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NubplQ9CWD8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms