Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW46

Raver1, Ribonucleoprotein PTB-binding 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver1Q9CW46 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Raver1Q9CW46 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Raver1Q9CW46 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms