Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.57
Sycp2Q9CUU3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Sycp2Q9CUU3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Sycp2Q9CUU3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms