Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930553M12RikQ9CUH1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930553M12RikQ9CUH1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms