Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Rhobtb3Q9CTN4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rhobtb3Q9CTN4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms