Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Sft2d3Q9CSV6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Sft2d3Q9CSV6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d3Q9CSV6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d3Q9CSV6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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