Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Dis3Q9CSH3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dis3Q9CSH3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms