Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM1

Type III endosome membrane protein TEMP, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQM1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQM1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQM1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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