Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ6

Denr, Density-regulated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DenrQ9CQJ6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
DenrQ9CQJ6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DenrQ9CQJ6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms