Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Snrpb2Q9CQI7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Snrpb2Q9CQI7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms