Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nudt21Q9CQF3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms