Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nipsnap3bQ9CQE1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms