Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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Trappc5Q9CQA1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Trappc5Q9CQA1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Trappc5Q9CQA1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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Trappc5Q9CQA1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trappc5Q9CQA1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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