Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ76

Nepn, Nephrocan, mousemouse

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Length 512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NepnQ9CQ76 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NepnQ9CQ76 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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NepnQ9CQ76 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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NepnQ9CQ76 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NepnQ9CQ76 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms