Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS7

Pno1, RNA-binding protein PNO1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pno1Q9CPS7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pno1Q9CPS7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms