Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bcl11bQ99PV8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bcl11bQ99PV8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms