Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL7

Scd3, Acyl-CoA desaturase 3, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd3Q99PL7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Scd3Q99PL7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms