Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc24a3Q99PD7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc24a3Q99PD7 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms