Protein–RNA interactions for Protein: Q99NG0

Rad54l2, Helicase ARIP4, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54l2Q99NG0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rad54l2Q99NG0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rad54l2Q99NG0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms