Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cep41Q99NF3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cep41Q99NF3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms