Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
NsmfQ99NF2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NsmfQ99NF2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms