Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Atoh8Q99NA2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Atoh8Q99NA2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms