Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp4Q99ME9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp4Q99ME9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp4Q99ME9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gtpbp4Q99ME9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtpbp4Q99ME9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms