Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr3Q99MB1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr3Q99MB1 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tlr3Q99MB1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tlr3Q99MB1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms