Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PtprtQ99M80 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PtprtQ99M80 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms