Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cttnbp2nlQ99LJ0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms