Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
Sh3bp5lQ99LH9 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sh3bp5lQ99LH9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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