Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Abcf2Q99LE6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Abcf2Q99LE6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms