Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TriobpQ99KW3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TriobpQ99KW3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms