Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
PpifQ99KR7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpifQ99KR7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpifQ99KR7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpifQ99KR7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpifQ99KR7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpifQ99KR7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
PpifQ99KR7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms