Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ciao1Q99KN2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ciao1Q99KN2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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