Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT6

Tlcd1, Calfacilitin, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlcd1Q99JT6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tlcd1Q99JT6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms