Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Krcc1Q99JT5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krcc1Q99JT5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms