Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apobec3Q99J72 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms