Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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Smim11aQ99J19 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Smim11aQ99J19 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Smim11aQ99J19 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Smim11aQ99J19 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Smim11aQ99J19 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Smim11aQ99J19 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Smim11aQ99J19 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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