Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc8b1Q925Q3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc8b1Q925Q3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms