Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clip1Q922J3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Clip1Q922J3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clip1Q922J3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms