Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpe65Q91ZQ5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rpe65Q91ZQ5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms