Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm2Q91YD4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm2Q91YD4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm2Q91YD4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm2Q91YD4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm2Q91YD4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm2Q91YD4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm2Q91YD4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm2Q91YD4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm2Q91YD4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trpm2Q91YD4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm2Q91YD4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm2Q91YD4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm2Q91YD4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm2Q91YD4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trpm2Q91YD4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Trpm2Q91YD4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trpm2Q91YD4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms